NSUN3 (NOP2/Sun RNA-metyylitransferaasi -perheen jäsen 3) on geeni, joka koodaa RNA-metyylitransferaasia ja osallistuu mitokondriaalisten tRNA:iden muokkaamiseen. Tämä muokkaus on tärkeää mitokondrioiden oikealle proteiinisynteesille ja toiminnalle. NSUN3-geenin mutaatioita on liitetty mitokondriaalisiin sairauksiin.